LipidView是一种数据处理工具！可用于从电喷雾质谱数据中对脂质种类进行分子表征和量化，有效简化工作流程，提供自动化数据处理，轻松获得可视化和结果报告！提高效率，LipidView 软件提供了一种用户友好的工作流驱动格式，用于从 ESI-MS 数据中识别和定量脂质种类。 该软件可以通过 MS/MS 碎片离子的数据库搜索进行识别和表征，并报告数字和图形输出，用于通过脂质头基、脂肪酸和长链碱基特征碎片和中性损失来分析各种脂质。LipidView 软件通过方法选择、脂质种类鉴定、峰强度同位素校正、基于多个内标的量化、脂质分布可视化和结果报告来简化自动化数据处理。
安装激活教程
1、在本站下载并解压
2、双击setup安装程序，安装完成，将patcher中的dll文件复制到安装目录中即可
功能特色
一、用于浏览脂质片段数据库的LipidView TM软件实用程序
1、脂质目录实用程序
脂质目录实用程序提供对超过23,000种脂质种类的整个脂质分类数据库的访问，检索分子式、单同位素质量、常见加合物、脂肪酸的m/z，以及以正极性或负极性列出的特征片段。如图2A所示，脂质目录实用程序演示了从PE 38:4的输入检索到的结果，遵循命名法：<headgroup>
<碳原子总和>：<双键总和>检索所需脂质种类的数据库信息，包括处理数据时实施的同位素校正因子。
2、脂质计算器实用程序
作为通过脂质名称检索脂质信息的替代方法，用户可以按给定的m/z值搜索脂质种类，无论是正极性还是负极性，并具有指定的质量容差。
图2B显示了在正模式下按父质量查询潜在脂质的输出，列出了单同位素质量在0.3 amu内匹配的所有脂质种类。还可以过滤检索到的列表以仅包括包含常见脂肪酸链组成的条目。
在LipidView软件中定义脂质内标
脂质类特异性内标的使用对于在任何质谱实验分析的样品之间进行定量测量或生成标准化比较至关重要。LipidView软件提供了一个专门用于实施和管理内部标准的模块，如图3所示。
二、该应用程序包含一个预
加载的非天然内标（由奇数链脂肪酸部分组成）的列表，通常用于对抗由奇数链脂肪酸部分组成的甘油磷脂、甘油脂、鞘脂和甾醇脂质类别。
此外，用户还可以通过填写所需信息来输入自定义内标，例如分子式、分子离子和特定扫描信息。一旦添加了内标和脂质数据库，用户就可以在处理方法中选择特定的内标，以在处理脂质质谱数据时应用。
三、开发脂质鉴定和定量处理方法
LipidView TM软件通过将处理方法应用于单个样品或一组样品，可以对ESI脂质数据进行批处理。处理方法设置模块如图4所示。在这里，用户定义用于提取原始数据和光谱峰预处理的参数，然后选择相关的脂质类以在数据库中搜索数据。处理方法由5个主要步骤设置，如下图4所示。
1.选择采集类型和极性。
2.定义频谱预处理。
3.提供进样详情：液相色谱（LC）、流动注射分析（FIA）或直接注入。
4.选择候选脂质类别进行鉴定
5.应用内标，确证分子离子
（加合物）和每个选定脂质类别的链/双键限制。
可以保存处理方法并将其添加到列表中以供将来使用。软件中有一套预装的处理方法；这些方法用作派生用户特定方法的模板
四、频谱预处理
在处理方法设置模块的光谱选项卡中，用户可以选择是否对数据进行平滑处理
（推荐）和来自较低质量物种的同位素贡献在进行脂质鉴定之前被移除。当处理来自复杂样品的数据时，该功能是必不可少的，其中脂质种类未及时解析，以确保从等压峰准确识别脂质，特别是通过一个双键不同的脂质。
五、应用内标进行脂质定量
内标参考峰可用于校正已识别脂质种类的峰面积或峰强度。默认情况下，根据内标信息条目中指定的默认脂质类别将内标分配给脂质。要自定义应用内标的方式，用户将打开Profile Tests以查看已识别脂质的完整列表，并查看每个内标自动分配给适用的脂质种类（Profile Tests Editor，如图5所示）。一旦所有脂质都分配了适当的内标，数值数据就会被标准化，并且可以创建定量脂质谱来比较样品之间的脂质丰度。
六、使用目标脂质列表创建方法
一旦LipidViewTM软件处理了数据文件并指定了内标来校正特定的脂质类别或特定的脂质种类，用户可以创建一个目标脂质列表，其中包含一组特定的脂质目标和内标参考峰以应用反对处理新数据集。当用户开发处理方法时，可以保存目标脂质列表，然后将其加载到应用程序中，如图4所示的处理方法对话框的上视图所示。使用目标脂质列表处理数据集完全依赖于与目标脂质并在脂质片段数据库中提供定义的搜索。这种方法有利于在脂质类特异性筛选实验中批量处理多个样品，因为它速度快，数据可以轻松对齐，并且脂质数据库中未描述的物种可以成为目标脂质列表的一部分。
七、解释LipidViewTM软件结果工作区中的数据
从AB SCIEX Triple QuadTM系统、QTRAP系统或QSTAR系统质谱仪采集的数据文件可由LipidView TM软件处理，通过提取通过特定调查或MS/MS扫描获得的光谱峰来识别脂质种类。来自调查扫描的光谱独立于相关MS/MS扫描（MS触发的MS/MS）中的光谱进行处理。然而，调查扫描和MS/MS脂质鉴定结果在结果工作区中耦合在一起。此外，如果用户选择存储无法分配给脂质种类的光谱峰信息，则这些结果也可以并行获得。
八、调查扫描和MS/MS数据审查
前体离子、中性损失、Q1、增强型MS或MRM调查扫描经过峰提取和前体质量数直接搜索脂质碎片数据库，以获得结果工作区中显示的脂质鉴定和光谱数据
（图6A）。已识别的脂质可分为三类：全部、已确认和已确认和常见。
确认的脂质是指多个互补光谱峰值测量指向单一脂质种类的鉴定。
已确认的和常见的脂质描述了其证据证实具有共同链组成的头基或脂肪酸的脂质。
可以选择所有选项来查看仅根据一次扫描的证据确定的脂质，其中没有确认数据（即缺乏脂肪酸数据）或提出具有不常见链排列的物种。
数值数据以峰强度、峰面积、强度百分比或由内标校正的代表值的形式根据脂质鉴定进行对齐。由信息相关采集(IDA)收集的MS/MS数据单独处理，并与结果工作区耦合，但可以独立查看（图6B）。由于MS/MS数据更可能包含多个确认离子，因此通过正和负MS/MS光谱识别的脂质通常得到很好的验证，可以单独查看和导出。可以过滤和分组样本，其中使用样本组之间的平均数据创建脂质分布图。此外，排序后的数值数据与结果工作区中的脂质谱快速查看之间存在直接联系。
九、高级脂质概况视图
还可以在高级配置文件视图中创建脂质配置文件，从而在扩展视图中按物种、类别或脂肪酸绘制大量脂质。如图
在图6C中，绘制了两个样品组的平均校正峰强度，用于直接比较。高级配置文件视图还允许用户创建辅助图。例如，在图6C中，总PE脂质类别绘制在主视图中，而下部图显示PE的脂肪酸组成
40:4来自互补脂肪酸数据。每个配置文件中绘制的数据显示在每个图表下方，以便于导出此类图表。
十、光谱视图
要查看原始光谱，光谱视图模块允许从已处理的数据文件中调用特定扫描或平均光谱。图6D是从红细胞(RBC)的相同光谱中减去显示的肝组织提取物的负模式下PIS为283.3 m/z的光谱脂质提取物。加载到光谱查看器中的光谱峰也可以用识别的相应脂质进行标记。
十一、从LipidView软件导出数据
结果工作区上部网格中显示的校正峰强度、峰面积数据、高级配置文件图形值或从配置文件测试中识别的脂质可以导出到文本文件(*.txt)。数据的导出保留了在LipidView TM软件会话中创建的样本分组或过滤器。此外，处理的样品保留了所有实验细节，例如为每个已识别的脂质对齐的母体质量和片段质量。
十二、创建报告
LipidView软件使用户能够直接创建MS Word格式的报告。样品和处理方法会自动打印在报告模板上，用户可以从结果工作区自动创建数值表。
此外，脂质剖面图和标记的光谱视图可以直接从结果工作区、高级剖面视图或光谱视图发送到报告。生成的报告会自动保存在给定的LipidView TM软件会话中，并且在查看存档的脂质结果时可以轻松地重新访问。
十三、结论
LipidView软件能够处理和审查来自各种不同采集类型的输液和LC ESI实验的MS和MS/MS数据-支持分析软件原始数据文件。
通过在内部数据库中搜索脂质片段和脂质分类来获得脂质鉴定。
用户可以从一套预先设计的模板方法中衍生和修改处理方法，用于两种极性的脂质识别和定量，并进一步针对指定的采集策略进行定制。
支持多方法批量文件处理，加工参数全程可追溯。
灵活的数据审查工作区，具有链接的数字和图形结果工作区，包含高级剖面视图、光谱视图和数据导出功能。
将数据自定义报告为MS Word格式