FlowJo是目前最受欢迎的流式数据分析软件，技术先进，功能强大，简单易用，可以分析细胞数据，采用色彩丰富的二维图进行系统分析，让用户更直观的了解细胞的状态变化。模拟分析数据价值高，拥有流动室和液流驱动系统，光电转换器和数据处理系统等先进的科学技术，能够满足研究人员的各项需求，帮助用户进行更高层次的研究分析，目前已经被领域内的科学家、实验室广泛引用。
功能特色
一、阶梯式设门
FlowJo独特的阶梯式设门试一次革命性的创新。他一改传统复杂的逻辑门设置，将细胞群之间的逻辑关系用简单的递进阶梯式去呈现，并可以自定义细胞群名称、进而直观的现实细胞群统计值，让分析结果一目了然，简单清晰
二、图像呈现法
1.多维参数显示
FlowJo提供了灵活的数据呈现方式，全方位满足用户的数据分析需要。它可以呈现一维的直方图，传统的二维图形，及动态立体的三维图形，从多个角度和空间对数据进行360°的静态以及动态解析
2.多种图形类型
FlowJo除了提供传统的散点图，还提供多种图形类型（如密度图，等高图，伪色图，斑马图等），在满足不同分析需求的同时还保证了图像的美观和科学严谨需求
三、多种设门工具
设门是流失数据分析中界定细胞目标群的必要手段，不管要检测的目标细胞群是规则分布还是不规则分布，小概率事件还是大概率事件，FlowJo提供了多种设门工具，从而让用户方便的界定各种细胞群
四、强大的批量处理功能
用户可以做一个样品的门分析，然后将这个分析批处理应用到其他样品上；也可以做一个样品的图形分析，然后将这个分析批处理用到其他样品上。这样避免了对每一个样品进行重复性试验的分析，即保证了数据分析的一致性及灵活性，同时也极大地提高了分析的效率并且得到完美的分析结果
1.门的批处理
你可以将一个样品的门分析，批量应用到其他的样品上。整个过程只需要轻轻拖动鼠标就可完成，非常简单
2.图形分析的批处理
图像处理也可以用批量分析的方法，将一个样品的分析应用到其他样品上
五、多种分析平台及工具
FlowJo自身包含了多个特殊的分析平台来满足细胞周期，细胞增殖，动力学（钙离子流量）等的分析。这些平台采用权威的已发表的模型算法原理设计，来精确模拟数据分布。FlowJo还包含了多种独特的分析工具，如数据联结、衍生参数轴、校准、Backgating、Show Ancestry、Sample Comparision等，让你对数据作进一步的深层分析及处理
六、荧光补偿
荧光补偿是六十分析里面一个重要的概念也是一个复杂的过程，却是流式分析必不可缺的部分。软件补偿一改过去在机器上手动调节补偿的冗长复杂过程，大大简化了荧光补偿过程，将补偿数据的过程变成一个可理解，可见的简单过程，同时提供了在机器上手动补偿所没有的精确度和灵活性
七、灵活方便的数据导出
数据的导出在FlowJo里面非常的轻松方便。不管是图形数据还是数据表格，都可以方便的导出成各种格式用来做数据的分享和发表