Flare是一个综合性的药物设计平台,包括基于结构和基于配体的方法,带来完整的基于配体和结构的药物设计的能力,深入分析探索,具有高分辨率3D可视化优势,高效准确地优化和确定相关信息、数据。提供完整的工具箱,仔细地计算和了解小分子,优化药物设计,通过应用各种不同的方法来简化整个过程,减少时间和精力上的投入,并提高药物开发成功率,也提供整个实验室共同研究、沟通协作的能力。
新功能
FlareV9的功能包括:
1、 蛋白质配体复合物的智能导入和处理
2、 准确可靠的蛋白质制备
3、 配体制备,包括对映体的生成、盐的剥离、pH7下的质子化和自身修饰
4、 序列对齐和叠加
5、 精确对接LeadFinder™
6、 先进的基于图像的信息和对齐
7、 使用FieldTemplater™构建药效团
8、 静电互补™地图和评分
9、Proteininteractionpotentials
10、 使用ActivityAtlas™和ActivityMiner™进行定性结构-活动关系分析
11、 使用FieldQSAR和机器学习方法进行回归和分类的定量SAR模型
12、 基于100多个群体的合成化学反应进行计数,得出文库和阵列
13、 热膨胀机化学分析
14、 R-群分解与分析
15、 使用Spark进行脚手架跳跃和生物异构体更换
16、 分子力学/广义角表面积(MM/GBSA)计算碰撞和保护自由能,单个保护信息或分子动力学的信息传感符号
17、 量子力学计算
18、 自由能扰动模拟
19、 支持OpenForceField
20、 分子动力学
21、支持动态和FEP计算,可自动创建数千个自定义扭矩参数
22、三维RISMwater分析
23、利用GIST进行基于MD的水热力学分析
24、通过口袋检测来识别潜在的药物结合位点,以吸引利益相关者
25、为感兴趣的目标创建可靠的3D结构
26、水蒸汽是一种具有约束力的现场能量学
27、使用XE和OpenMM最小化蛋白质配体复合物
28、TheFlarePython™API